Похожая фигня была в нашем зоопарке. Уже не помню сколько лет назад, когда стало ясно, что старый db.cgi абсолютно не редактабелен, мы собрали группу z-db-v2 для проектирования второй версии базы. Я тогда собирался переписывать всё с нуля. Но довольно быстро понял, что не осилю. Это потребовало бы год еженедельной работы, и ещё кучу времени на доведения до ума. Ну и когда у меня появился шанс вернуться к проекту, решил, что база-то работает, а канделябр -- нет. Теперь я иду, как мне кажется, более правильным путём -- реализую мелкие возможности в параллельной ветке кода, постепенно наращивая мясо на ядро.